哈尔滨工程大学和合肥工业大学在不同维度上的影响力各有侧重，哈尔滨工程大学在国防科技和船舶海洋领域影响力突出，合肥工业大学在南方地区及工科综合应用领域更具优势，具体分析如下：

哈尔滨工程大学以“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋工程、核能应用）为特色，是船海核领域国内顶尖的研究型大学。其船舶与海洋工程学科在第四轮学科评估中获评A+，与上海交通大学并列全国第一，且在核工程与核技术、自动化、计算机等学科领域也具备显著优势。学校拥有多个国家级科研平台，科研成果直接应用于国防和国家重点工程，例如为“蛟龙号”载人潜水器提供水下导航定位系统国产化装备，支撑中国首条三体搜救艇、万吨集装箱船等新船型开发。其毕业生在船舶、海洋、核能等领域的就业认可度极高，超半数进入大型国企，就业率长期保持95%以上。

合肥工业大学被誉为“中国汽车工业人才的黄埔军校”，在机械工程、车辆工程等传统工科领域积淀深厚，管理科学与工程学科在第四轮学科评估中获评A类，全国排名前10%。学校依托3个国家级重点实验室和6个教育部工程研究中心，年均科研经费超10亿元，在新能源汽车、工业机器人等新兴领域成果显著，与华为、比亚迪等头部企业合作紧密，毕业生就业率常年超95%，部分专业起薪超行业平均水平30%。此外，学校位于长三角副中心城市合肥，区域产业红利与学校发展同频共振，形成“实验室+企业实习+学科竞赛”的三维培养模式，学生实践能力突出。