除了接种相关病毒疫苗和细菌疫苗外，要采取相应的办法保护婴儿：还没有来得及接种疫苗的新生儿，不要让过多的人接触；尽量不要亲吻孩子，尤其是不熟悉的人；如果有人生病、咳嗽、打喷嚏，就不要让他接触孩子；尽可能不要带孩子去人多拥挤的地方；为孩子准备食物、奶瓶等之前要认真洗手；抱孩子或者摸孩子脸部之前要认真洗手；孕妇在怀孕35-37周之间检测B族链球菌，阳性者在生产时服用抗生素；有蚊子的季节要采取防蚊措施；避免二手烟，因为会增加病毒和细菌感染的风险。 婴儿脑膜炎的治疗看病因，如果是细菌性脑膜炎，就静脉输入抗生素。病毒性脑膜炎通常不严重，除非新生儿患单纯疱疹病毒导致的脑膜炎，病毒性脑膜炎的预后比细菌性脑膜炎好，大多数患儿没有并发症。
