韦昌辉杀了杨秀清一家后，大搞株连，搞大屠杀，凡是杨秀清的亲属、部下和有关系的人都杀了。很多人认为韦昌辉此举不仅违背了洪秀全的命令，还把自己推向了天国的对立面。其实，韦昌辉之所以那样做，还是形势所迫。他从前线带回来3000人的精锐，不采取铁血手段，在血洗了东王府后，很可能会被东王余党报复。杨秀清本身有节制诸王的权力，势力很大，在天京城内遍布党羽。韦昌辉能力再强，也明白杀了杨秀清以后，必须斩草除根，否则自己哪天被暗杀都不知道。 洪秀全始终没有对外公布诛杀杨秀清的原因，只是以密诏的形式让韦昌辉除掉他，但也没有让他大搞株连。韦昌辉杀红了眼，不管不顾，惹得天怒人怨，也是必然的结果。
