希腊的国境线一直伸到土耳其的海岸线上了，爱琴海上的2500多座近海岛屿90%都属于希腊，土耳其仅有60余个小岛。
历史上爱琴海整片区域曾由奥斯曼帝国统治，岛上居民多为希腊族群。巴尔干战争后，奥斯曼战败，部分岛屿划归希腊。
一战奥斯曼作为同盟国失利，1923年《洛桑条约》确定爱琴海大部分岛屿归属希腊，土耳其仅保留沿岸极少数小岛。原本被意大利占据的罗德岛等十二群岛，在二战后依据《巴黎和约》移交希腊，现代版图格局正式形成。
当初西方列强如此划分，一方面考虑岛屿居民民族构成，另一方面意在限制土耳其，掌控东地中海航道。
如今双方争端不断：希腊希望将领海拓展至国际通用的12海里，一旦实施，土耳其船只出海极易进入希腊领海。土耳其对此强烈反对，还对部分无人小岛存在主权分歧。两国同属北约，却长期因地缘、海域划分问题对峙，爱琴海争端至今未能解决。