对于传统认为的“黄芩治上焦，黄连治中焦，黄柏治下焦”是指三药的作用部位有所侧重、有所擅长，选药时可作为首选药考虑：上焦肺热、湿热多选用黄芩；中焦湿热、胃热、胃火多选用黄连，尤其是中焦湿热泻痢；下焦湿热、阴虚火旺多选黄柏。但并不是黄芩只治上焦，黄连只治中焦，黄柏只治下焦。如姜春华所讲：“某些药物作用于某些系统，也有不必拘泥的。如黄芩、黄连，古人也有用于下焦病，黄柏也用于上部病，因为消炎清热作用是它们的共同性。”