1949年8月，蒋介石到重庆布置西南防御。特务头子徐远举与四川军阀杨森等人联络发动了十来万帮会分子与四川袍哥等人，冒充重庆市民搞了一次盛大的夹道欢迎，很博得蒋的欢心。 西南军政长官张群在接到蒋介石的指示后，也跟着召开了长官公署的扩大会议，指定徐远举作“军情报告”。 徐远举连夜打电话到昆明和贵阳等地搜集有关各地的游击队的情况。沈醉用了几乎一个小时，把云南和滇桂、滇黔边区的有关游击队的活动、人数、装备等都详细地告诉了他。当时徐远举是保密局西南区区长，名义上是可以指挥沈醉这个云南站长的。 徐远举利用西南特区的关系和长官公署二处搜集到的大量材料，在会议上，向在西南地区的国民党军政头目们做了军情报告以及分析、判断。张群在会上对徐远举的表现大加赞扬，会后志得意满的徐远举立即打长途电话告诉沈醉，许多与会的高级军政人员，除当面称赞他的报告很有内容外，还向他要材料，特别是云南方面的情况，因为沈醉向他提供的许多东西，都是报上没有发表过的。 当时云南局势十分引人注目，国民党云南省主席卢汉和蒋系人马矛盾很大，卢汉把蒋派到云南的警备总司令何绍周赶走，并请求撤销警备总司令部，成立云南绥靖公署，由卢汉任主任，集军政大权于一身。 蒋介石于9月初决定要解决云南问题，但又抽不出多余的军队加强对云南的控制，只好采取张群的意见，要卢汉到重庆走一趟，来看其的表现。蒋介石怕卢汉不来重庆，派蒋经国到昆明当面劝说。 卢汉考虑到起义时机还不成熟，所以只好硬着头皮去见蒋介石，答应蒋对云南来一次“整肃”。卢汉于9月9日上午由重庆返回昆明后，紧接着由蒋介石、毛人凤派遣执行“整肃”任务的徐远举便带着一大批特务于下午到达昆明。 沈醉到飞机场去接徐远举，徐远举一下飞机，带着几个特务急忙跳上沈醉的汽车，要求直接驶往杨杰家中。结果杨杰在他抵昆明前已乘机飞往香港去了。徐远举扑了一个空，对沈醉大加埋怨，说这是蒋亲自指示要抓的主要人员，并指示抓到后即由他乘坐的飞机押往重庆，现杨杰逃走了，如何向蒋介石复命？ 杨杰住在沈醉家斜对面不远，沈醉曾多次接到毛人凤要我暗杀他的密令，最后一次沈醉正安排几个特务去刺杀他，不料被他母亲知道了，严厉责备他一顿，沈醉和杨杰私交不错，也就借此取消行动，对杨杰逃往香港睁一只眼闭一只眼。 徐远举没有抓到杨杰，立即要沈醉当晚集合在昆明所有的公开单位的特务，由他去见卢汉，让卢汉同意解散省参议会，逮捕一些参议员，查封几家报社。并由徐远举和沈醉出面，约集昆明市警察局、宪兵团和刑警大队等单位负责人开紧急会议，说明卢汉已接受蒋的命令，在昆明进行一次大规模的抓捕。当晚全城戒严，分途逮捕，一夜之间捕到了300多人，其中有省参议员20多名，查封了 几家报社、广播电台，并拘捕了所有的员工。 第二天，徐远举又亲自率领宪兵、警察、特务到昆明西部海口五十三兵工厂，逮捕进步员工30多名。接连三天大逮捕，虽已捕到近400人，但经初步审讯，并没有逮捕到云南地下党负责人和重要的民主人士。 蒋介石接到报告后，很不高兴，又于12日派毛人凤到昆明加强镇压。随同毛去的有西南特区副区长兼督察主任周养浩和贵州省站长兼贵阳警备司令陈世贤、保密局高级法官徐钟奇等人。 毛人凤在沈醉昆明的家中住了一个多月。以他的保密局局长之威，也没有把云南地下党破获，恼羞成怒的毛人凤，派人到香港杀害了杨杰。毛人凤希望借卢汉之手，把“九九事件”中抓到的人杀一大批，让卢分摊血债而不敢起义，卢一直不同意。 9月22日，蒋介石由重庆返回台湾时，绕道昆明，停留了几小时，只有蒋经国、毛人凤、徐远举和沈醉四个人，事先到机场等候，并告诉了昆明空军副司令沈延世和场长蒋绍宇。一直到蒋的座机快到昆明上空时，蒋经国才打电话通知卢汉到机场迎接，在卢汉家中吃一顿午饭便飞走了。因为蒋害怕发生类似西安一样的“事变”。 卢汉并不因蒋介石到昆明，当面指示他与毛人凤好好配合搞“整肃”而有所畏惧，还是一个劲地推说杀人要按手续。毛人凤把要杀的人一减再减，他仍然不在名单上签字。 毛人凤要徐远举先回重庆，把囚禁在重庆白公馆和渣滓洞的人除已公开杀害的几批外，将现仍在押的列一详细名单，准备在必要时处理。当时毛人凤住在沈醉家，他在审阅重庆送来的名单时，沈醉看到有几个我认识的军统小特务，或因贪污敲诈，或因吸食鸦片烟，毛人凤也在上面圈了杀的记号。沈醉请求他释放这些人，他把笔一搁，说留下来只会添麻烦，不如一次解决算了。所以在那次大屠杀中，有几个虽是军统特务，徐远举也把他们列到了名单中。 沈醉是戴笠的红人，当年是军统最年轻的少将，毛人凤执掌保密局后，将沈醉从总务处长职务上打发去了云南，两人之间是貌合神离。毛人凤在昆明沈醉家中时，沈醉一度想用毒药解决掉毛人凤，但最后还是心软了。 10月15日，毛人凤由昆明飞回台湾。多年后，沈醉回忆当年未能下决心毒死毛人凤，深以为憾。
