1944年，陈诚到昆明视察，在欢迎宴上，他去夹油炸锅巴时，关麟征讽刺说：“陈部长，我们老家有句话，不吃锅巴，不围着锅台转。”陈诚听了之后，和关麟征当场对骂，回去后气得吐血。 关麟征和陈诚结怨于1929年，陈诚在挤走原师长曹万顺，正式接管十一师后，人事进行了大调整，大部分的变动，陈诚是满意的，比如他的保定军校同学罗卓英当了副师长，亲近他的黄埔军官也都有升迁。陈诚最不满意的是，和他不和的关麟征被蒋介石点名由团长升任旅长。 没过多久，在陈诚的运作下，关麟征去了新编第五师当副师长。陈诚以副师长身份最终控制十一师，最主要的原因是他就任的时候，老蒋将原总司令部的精锐部队编为一个旅，并入十一师，有武力依靠的陈诚，行事当然有恃无恐。关麟征是孤身一人去的，又是老蒋势力薄弱的陕西，自然是另一番形势。 新编第五师是陕西军阀部队改编而来，地方气息很浓厚，军官的年龄都偏大，24岁的关麟征去当副师长，别说年龄比师、旅、团长们都小，即便是大部分的连长，也都比关麟征年龄大。该师主要军官，一个个视关麟征为仇寇，让他的工作根本无法开展。 后来，师长邓英去南京受训，刚走没有几天，竟然有将近两团人马哗变，成了匪兵。关麟征无计可施之际，团长公秉藩主动跑来说：“你是南京派来的人，我和弟兄们推举你当师长，到时候你得保举我当旅长或副师长。” 关麟征和陈诚交恶的起因，就是陈诚任十一师副师长时，曾授意该师黄埔军官联合起来，状告曹万顺以达到挤走的目的，关麟征不齿这种上不了台面的行为，出言讥讽，被陈诚记在心中。此次，公秉藩想做类似的事，关麟征也是很干脆的拒绝了。 在新五师实在待不下去的关麟征，自行跑去了南京。老蒋召见他的，倒也没有过多指责，让他去张治中的教导2师当团长。关麟征在一年时间内，由团长升到旅长，继而担任副师长，结果顷刻间又被打回原形，重任团长，这里面的陈诚这个推手“功不可没”，本就性烈如火的关麟征，自然记在心中。 张治中的教导师，在中原大战中表现不错，关麟征战后因功升任旅长。长城抗战前夕，关麟征的部队扩编为25师，划归徐庭瑶的十七军序列。长城抗战打响后，十七军奉命北上作战，关麟征和副师长杜聿明率部疾驰，成为该军第一支到前线的部队。战后，关麟征获授“青天白日勋章”。 “西安事变”中关麟征的反应，使他成为老蒋心目中的“可信任”之人。在事变爆发，老蒋被扣押后，复兴社中邓文仪、贺衷寒等黄埔一期的骨干分子，积极向极力主战的军政部长何应钦靠拢，他们对宋美龄也表现出了不爱搭理的姿态。事变和平解决后，老蒋对邓文仪、贺衷寒等曾经的心腹，打入另册，不再重用。 关麟征的25师驻扎在宁夏，他在事变爆发后，主动去找“宁马”的军事首领马鸿逵，一番说辞下，马鸿逵竟然和关麟征对天起誓，结为兄弟。老蒋对马鸿逵在事变中的表现很满意，认为关麟征的协调应居首功，去电嘉奖。 台儿庄会战中，时任52军军长的关麟征，率部在反攻阶段，正面击溃了五千余人的日军坂本支队后，又从后方侧翼包围了进攻台儿庄的濑谷支队。战后总结，反攻阶段，以52军战果最大，老蒋在军事会议上表扬说：“如都象52军那样战斗力强，打败日本军队是不成问题的。” 此后，关麟征成为继胡宗南之后，蒋军黄埔将领中第二个升任军团长、集团军总司令的。日军从维希法国手里夺取越南后，关麟征奉命率第九集团军驻守滇南，和日军展开数年的对峙。 陈诚“土木系”仅次于十八军的主力部队54军，划归第九集团军后，关麟征一直盯着，试图将该军吞并到自己的小集团中。1943年，54军军长黄维因军粮问题，和军政部长何应钦发生冲突，导致被调离该军。 关麟征让第九集团军副总司令张耀明（关麟征的陕西老乡，黄埔一期同学，两人私交极好）去兼任54军军长，陈诚怎么可能让关麟征如愿，他授意该军军官直接给老蒋写联名信。事情闹大后，老蒋干脆把54军调去了霍揆彰（54军首任军长）的二十集团军，调十八军军长方天到二十集团军任副总司令兼54军军长。 1944年底，接替何应钦担任军政部长的陈诚，到昆明视察，云南的军长以上将领都去参加了欢迎宴席。席间，陈诚坐在首位，关麟征和昆明防守司令杜聿明等人陪同，在上了一道油炸锅巴时，关麟征在介绍菜时，言语间讥讽陈诚，说他没有心胸。 陈诚是国民党军的陆军一级上将、位高权重的军政部长，席间被一个中将如此羞辱，这让他面子上很难看，当场和关麟征互骂起来。陈诚有严重的胃病，被这么一气，回到住所吐血不止。 杜聿明劝关麟征低个头，关麟征愤愤的说：“我就是要对着干，北伐靠的是我们这些黄埔生，到头来指手画脚的都是陈诚这类人。” 关麟征这个蒋军黄埔生中的代表人物，虽受重用，在老蒋心目中的地位比之陈诚还是大不如，他和陈诚公开决裂，后果是严重的。1945年初，军委会组建了四个方面军，黄埔三期的王耀武一跃成为方面军司令之一，而关麟征只挂名了一个副司令，他的军事生涯到头了。
