1928年11月，冯玉祥召集西北军师长以上将领到南京，韩复榘不愿去，写了一封信让孙桐萱转交。冯玉祥看了信后，大发雷霆。 不久前，冯玉祥去南京担任行政院副院长兼军政部长，并召集师长以上将领来开会。 韩复榘不愿去南京见冯玉祥，将孙桐萱叫来说：“我身体不好，你代我去见冯总司令。” 孙桐萱说：“我听说其他师长都去南京，你不去怕不好吧？” 韩复榘说：“你就说我病的严重，这里有封信，你去后亲自交到冯总司令手中。” 韩复榘是冯玉祥手下“十三太保”中的代表人物，这次不愿去南京，就是在闹情绪。按照孙桐萱的说法，韩复榘和冯玉祥的关系产生裂痕，主要有三方面原因。 一是，韩复榘在“二次北伐”中的表现，在西北军将领中是数一数二的，但因他有短暂投靠阎锡山的经历，冯玉祥对他时常敲打，批评的多，表扬的少。论战功，韩复榘一点都不比孙良诚差，可冯玉祥在军事会议上，总是一味夸赞孙良诚，在击败张宗昌的直鲁联军后，推荐孙良诚当了山东省主席，韩复榘对此很不服气。 二是，韩复榘率部击溃奉军，攻占北京南苑时，其余友军尚在路上。立下这样的大功，韩复榘的职务却原地踏步，在各集团军的部队编遣时，他的部队缩编为二十师，他由军长变成了师长。 三是，韩复榘心态上有了很大变化，他认为自己有投靠晋军的经历，在冯玉祥眼中，属于有劣迹的人，再怎么努力，也不会像孙良诚那样，因此颇有点破罐子破摔的味道。 孙桐萱到南京后，不敢把信交给冯玉祥，便去找西北军的副总参谋长秦德纯问计。 秦德纯问：“韩向方在信中写的什么内容？” 孙桐萱说：“信皮封着，我不好拆开。不过，他向我大致说过，里面的内容是索要积欠的军饷。” 秦德纯叹气说：“这个韩向方，西北军苦穷，各部队都积欠军饷，又不是光欠他的了。” 孙桐萱问：“那就不给冯总司令看了？” 秦德纯说：“你若不把信递上去，回去后怎么交待？其实这也不算大事，就怕韩向方在信中口气不好，惹得冯总司令不高兴。” 孙桐萱很是为难，考虑了许久，还是在冯玉祥召见他时，将信递了上去。一听是韩复榘转交的信，冯玉祥还很高兴，可在看完后，气得脸色大变，把信纸一扔，问孙桐萱：“军饷确实低，可大家都低，答应给你们师的军饷，我可克扣过一分。” 孙桐萱连连说：“没有，没有。” 孙桐萱离开南京返回驻地的路上，就听到韩复榘被任命为河南省主席。韩复榘当了省主席后，非常高兴，让孙桐萱代理二十师师长，他则忙着去省府所在的开封当差。 然而好景不长，冯玉祥免去了韩复榘二十师师长的职务，由总部参谋长石敬亭兼任。石敬亭到任后，召集二十师官兵训话时，骂他们军纪败坏，形如土匪。 韩复榘在师部的亲信，大都被石敬亭撤换，这帮人跑去开封找韩复榘哭诉。韩复榘本就和石敬亭不和，拉不下脸去求情，便将这帮人安排在省府任职。 调整完师部的人后，石敬亭又寻找机会撤换部队长。一天，石敬亭路过郑州时，因未提前通知，驻扎于此的旅长兼警备司令赵仁泉没有来得及到站迎接。 石敬亭到了警备司令部后，指着赵仁泉臭骂一番，然后将他撤职，由李文田接任。赵仁泉是韩复榘心腹，因为这么一件小事，就丢掉了军职，很明显是石敬亭为了消除韩复榘在二十师的影响力，而故意为之。 韩复榘对被夺去兵权本就不满，新任师长石敬亭又是这番操作，使得他内心反叛的种子不断生根发芽。 1929年初，冯玉祥辞去在南京的职务，返回河南。韩复榘闹情绪，不愿去见冯玉祥，找了个借口离开开封，驻军开封的师长石友三，也跟着韩复榘走了。 冯玉祥到开封后，见迎接的人员中没有韩复榘，便问：“韩主席去哪里了？” 有人回答说：“韩主席去许昌视察去了。” 冯玉祥又问：“石友三怎么也不见了？” 石部副师长说：“石师长有事去郑州了。” 冯玉祥脸色很难看，随后在省府召集军政人员开会，批评说某些人，打了胜仗后，自命不凡，你找了一个说书的，他找了一个唱戏的，生活腐化不堪，成何体统。 “某些人”指的就是韩复榘、石友三，因为两人新纳的姨太太，刚好就是说书的、唱戏的。 话传到韩复榘耳中，他不满的对亲信说：“我追随总司令多年，没有功劳也有苦劳，如此不留情面的说我，太让人难堪。” 石敬亭当了三个月师长后，又回总部继续当参谋长去了，二十师师长由总部训练总监李兴中接任。石敬亭当师长期间，虽调换了部分韩复榘的亲信，但孙桐萱等骨干分子还在，李兴中到任后，未对人事再进行大的调整，这就为后来韩复榘重新掌握二十师埋下了伏笔。 蒋桂大战爆发后，冯玉祥派韩复榘去武胜关督师，韩复榘到后不待有动作，桂系已落败。蒋介石到汉口后，接见了韩复榘，并赠送了三十万元。 随着桂系的失败，蒋冯大战一触即发，冯玉祥为了集中兵力，下令部队西撤集中。在华阴召开的军事会议上，韩复榘反对西撤，说不应放弃山东等广大地盘，遭到冯玉祥痛斥。 会尚未开完，韩复榘就气冲冲的离开，回到二十师驻地后，下令部队东进，公开叛冯投蒋。
