1949年9月，毛人凤拿着一份四百多人的枪决名单让卢汉签字，卢汉以证据不足拒绝签字。毛人凤说：“那就杀一半，留一半如何？” 1949年9月，毛人凤奉蒋介石密令来到昆明，带来了一份长达四百余人的枪决名单。 这份名单上，多为国民党内部被怀疑“通共”的官员、士兵以及部分社会精英，甚至包括一些无辜百姓。毛人凤亲自将名单呈交给卢汉，要求他在上面签字批准。 “卢主席，这是‘九九整肃’的名单，是蒋委员长的命令。”毛人凤态度强硬地将名单递上。 卢汉接过名单，皱眉快速浏览了一遍。他很快发现，这些人中许多并无实质性的证据证明其“通共”或叛国行为。 相反，名单上的不少名字都是云南本地有声望的人士，甚至包括几位他个人非常熟悉且敬重的学者和商人。 “毛主任，这份名单太草率了吧？一没有确凿证据，二未经军法会审，如何能随意处置这么多人？”卢汉语气虽平和，但语气中已显不满。 毛人凤冷笑一声：“卢主席，国共交战已至存亡关头，疑人即用。越是对这些人手软，越是为敌人提供喘息机会。委员长的命令，毋庸置疑。” 卢汉放下名单，直视毛人凤，坚定地说：“没有证据，一个人都不能杀。” 毛人凤眉头紧锁，显然没想到卢汉会如此明确地反对。 他收敛了几分傲慢，换上一副近乎恳求的语气：“卢主席，这些人中或许有一些问题不大，但全不杀，岂不便宜了那些真正的叛徒？要不这样，杀一半，留一半，总可以吧？” 卢汉依然摇头：“未经军法会审，草菅人命，云南不能开这个先例。毛主任，请回去告诉委员长，我卢汉一人承担这个责任。” 毛人凤自然不肯轻易罢休。他深知，卢汉的拒绝不仅是对他个人权威的挑战，更是在间接抵抗蒋介石的威令。 于是，他暗中安排特务在昆明散布谣言，声称卢汉包庇通共分子，并煽动对卢汉的舆论压力。 同时，他密令手下将枪决名单中的一部分人秘密抓捕，关押于昆明的一处隐秘监狱，伺机动手。他试图通过既成事实迫使卢汉屈服。然而，卢汉很快得知了这些行动。 卢汉当即召集军法处及属下将领，勒令全面检查当地的拘押情况，并警告道：“任何未经军法会审的羁押和处决，都是违法行为。若有擅自行动者，定会追究到底。” 为了进一步保护名单上的部分人员，卢汉暗中安排可信赖的部下，将部分学者、商人转移到安全地点。毛人凤的计划屡屡受挫，气急败坏，却始终奈何不了卢汉。 在一次高层会议上，毛人凤再度当众质问卢汉：“卢主席，如今共产党势力已逼近云南，我们内部的问题却得不到清理，是不是您的态度太过犹豫了？” 卢汉不慌不忙，反问道：“毛主任，云南军民一向忠诚，凭什么把这些人一刀切地视为叛徒？谁给你的权力，凌驾于军法之上？” 会议室内一片寂静，所有人都屏息注视着这场争锋。毛人凤怒不可遏，却无言以对。他深知，卢汉的地位远高于他，公开硬碰硬，毫无胜算。 毛人凤多次向蒋介石告状，要求“调离卢汉”。然而，蒋介石此时正深陷四面楚歌之中，对卢汉这个云南地方实力派，仍需笼络，不敢轻举妄动。 他表面上批评卢汉“态度暧昧”，实际上却选择了搁置此事。 最终，毛人凤被迫带着名单离开云南，而所谓的“九九整肃”未能在云南彻底施行。 卢汉的坚持，不仅避免了数百条无辜生命的惨死，也在一定程度上保护了云南地方社会的稳定。1949年底，他顺应大势宣布起义，云南和平解放。 多年后，有学者评价说，卢汉在九九整肃中的抗争，是他为云南和平解放埋下的重要伏笔。 至于毛人凤，他虽对卢汉怀恨在心，却因其“工作失职”受到蒋介石的训斥。从此之后，他在云南的特务行动变得更加隐蔽，却再未能掀起大的波澜。
