正当左宗棠准备亲自督战收复新疆时，慈禧太后因听了李鸿章的一席话，却下旨召回左宗棠，说是让他回京执掌军机。此时的左宗棠是多么不情愿啊，再怎么样也要等会收复伊犁了再召回才是，可圣命难违，他只能听命。 左宗棠来哈密半年的时间，为哈密乃至新疆人民办了很多实事，为民谋福者民心所向，大家都舍不得他，于是在听说了左大帅要回京时，纷纷来到哈密城外凤凰台左宗棠扎营的地方来送行。而李鸿章到底跟慈禧太后说什么，便突然有此重大决定？ 本来全国大部分的将军督抚都支持对俄国采取强硬态度，可李鸿章却主张不必改约，更不必重开谈判，而慈禧又说起左宗棠的奏折，说非与俄罗斯一战不可，左宗棠的主战理由便是主战以自强才能有和谈的资本，越是退让，俄方只会越嚣张。可李鸿章却不以为然，反而说起左宗棠的这种想法很危险， 李鸿章认为，大清已经处于半殖民地半封建的状态，又有土地被割让和侵占。 英国和俄国两大势力对中国虎视眈眈，构成了巨大的威胁，李鸿章担心收复新疆会引发更大的国际冲突；所以他不仅反对用武力收复伊犁，甚至认为左宗棠都不该出现在新疆。而没等慈禧太后开口，李鸿章又说起，现在战端一开，哪里只有会危及到西北，还有北方及东北，俄国屯兵的中俄边境都会起战事，左宗棠的西征军真的顾得过来吗？慈禧本就因为戈登的话本就顾虑重重，现在一听李鸿章所言，看来不迁国都真的无法开展战事，而且国力本就空虚，用什么去言战呢？于是慈禧便下诏让左宗棠回京执掌军机，而这里面有两个用意，第一便是让俄国放心，左宗棠不会对伊犁产生大的威胁，而第二个便是让俄国惧怕，因为新疆有刘锦棠在，一样可以收复伊犁，而左宗棠坐镇京师，他们更加不敢造次。而西征军的将领们认为是第一种，便纷纷劝告左宗棠不要回京，只有飞将军刘锦棠不这么看。 当左宗棠笑呵呵的从外面散步回来时，看到将领们垂头丧气。左宗棠说起，他这次回京， 大家应该感到高兴才对；刘锦棠也说起，这次是让左大帅去执掌军机担任顾问，这是高升，大家应该恭贺才对，于是大家也收起悲观的情绪，纷纷恭贺他。
