Anthropic昨天放了个大消息:他们的Claude在DNA数据库里自己翻出了一套全新的酶系统,结构长得像CRISPR。这是他们湾区生物实验室今年春天开张后的第一个成果。
950个智能体翻了21小时
事情是这么开始的。科学家只给Claude一句提示,去DNA序列库里找有趣的逆转录酶。剩下的是Claude自己干的:大约950个智能体并行跑了21小时,烧掉2.1亿token,从超过20万个逆转录酶里筛出3500个候选系统,最后挑出20个做深入分析。其中一个智能体盯着一段DNA序列突然发现不对劲,旁边有个奇怪的基因,基因边上排着一串整齐的重复序列。
DNA序列与酶结构示意图(来源:Unsplash)
Claude像人类科学家一样先数了数重复、量了量间距,又去翻文献看有没有人报过这个模式。确认没人的报告后,它写了一份给人看的报告。科学家拿到报告,拿去实验室做实验验证,确认这是一种之前没人描述过的酶系统,存在于噬菌体(感染细菌的病毒)里,他们起名叫array-associated reverse transcriptases,简称ART。
结构酷似CRISPR,功能还不知道
ART由三部分组成:一个逆转录酶、旁边一个搭档基因,还有一长串均匀间隔的DNA重复序列。这个排布跟CRISPR的重复序列阵列很像。CRISPR当年也是被科学家先注意到"这段重复序列好奇怪",后来成了基因编辑的底层工具。初步实验显示ART的重复阵列会被转录成一组不同的短RNA,暗示它可能也有类似CRISPR的可编程潜力。
不过Anthropic话说得很清楚:ART具体干什么活,现在还不知道。底层那个逆转录酶以前有研究报过,Claude是第一个看出"这仨东西凑一起是个完整系统"的。他们已经把预印本放出来了,后续实验还在做。
MIT和Broad研究所的Feng Zhang,CRISPR基因编辑的先驱之一,看完预印本说,这是AI智能体参与生物发现的激动人心的例子,RNA重复阵列连着逆转录酶这个组合确实值得深挖,希望更多科学家能借AI推进自己的研究。
从"看出奇怪"到AI接手
这次发现的含金量在于效率。Anthropic说,这种规模的分析,人类专家通常要花几周到几个月。Claude一天不到就干完了。而且它不是在重复已知结论,是在没人标注过的原始序列里自己看出异常。
生物学家过去几十年的重大突破,好几次都是从"这里有点奇怪"开始的:限制性酶、Taq聚合酶、CRISPR本身。现在这个"看出奇怪"的活,AI也能干了。
消息来源:Anthropic官方博客、Reuters、TechCrunch,9月23日