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巴青县隶属于西藏那曲市,位于西藏东北部、藏北高原与藏东高山峡谷过渡地带,北接青海

巴青县隶属于西藏那曲市,位于西藏东北部、藏北高原与藏东高山峡谷过渡地带,北接青海,东邻昌都,国道317横穿境内,是藏北重要交通节点。全县平均海拔4500米以上,地势整体北高南低,唐古拉山脉横贯县域中部,地貌以高原丘陵、宽谷河谷为主,地形起伏较大。

气候上,巴青县属于高原亚寒带半湿润气候,高寒缺氧、气温极低,年均气温在0℃以下,昼夜温差悬殊。全年风力强劲、降雪频繁,无霜期极短,自然生长条件恶劣,但降水相较于纯藏北荒漠草原更为充沛,水资源相对丰富。

水文方面,该县地处怒江上游源头区域,跨长江、怒江两大水系,境内河流、湿地、高山湖泊众多,是青藏高原重要的水源涵养区。植被以高寒草甸、高寒草原为主,草场面积广阔,是藏北核心天然牧区,生态系统独特,珍稀高原野生动物分布广泛。

县域处在巴青—类乌齐活动断裂带上,地壳运动活跃。10月22日22时33分玛如乡发生7.0级浅源地震,震源深度10千米,之后多次发生余震,最高为5.7级,震区地表出现破裂,滑坡、冻土崩塌等次生灾害风险较高,高寒环境也加大了抢险安置的难度。
地理