涉案经营主体已被认定无证非法生产、多项违法，主观故意明显，属于制假售假重大案件。涉事经营者负有召回全部同批次涉案假种子的义务，召回范围包含举报人购买留存的该批次种子，农业行政机关有职责责令其完成全部召回、管控风险。经营者仅退回部分种子，大部分种子已经流入农户田间种植，危害后果已经形成；另有同批次假种子留存仓库未召回，违法风险没有消除。该情形不满足《行政处罚法》“主动消除或者减轻违法行为危害后果”的法定适用条件，不能以此作为减轻处罚的依据。在主观故意明显、危害已经发生、涉案种子未全部召回的情况下，据此减轻处罚，不符合行政处罚过罚相当原则。