朱棣率兵攻入南京时，俘虏了朱允炆的生母吕氏。看见吕氏狼狈地摔在地上，朱棣上前搀扶，说：“大嫂，老四不想闹成这样，这是被逼无奈，走投无路。”
朱棣打进南京，抓了建文帝的生母吕氏，她摔在地上，朱棣伸手去扶，嘴里说大嫂，老四也不想弄到这一步，可这话谁听都知道是场面话，吕氏一辈子在宫里过日子，哪见过这种刀光剑影，眼睁睁看着儿子的皇位被人抢走，自己转眼就成了囚犯。
靖难之役一结束，南京城里就乱成一团，朱棣说他是被逼的，这话倒也不是全假，建文帝刚坐上皇位就削藩，朱棣在北平手握兵权，不反就得死，吕氏心里清楚，这人分明是来夺位的，宫里宫外没人敢惹他，吕氏就算再不情愿，也只能把眼泪憋回去。
史书里只轻飘飘写了一句“吕氏被送出宫”，没人管她当时说了啥，宫里那会儿还闹出个大谜团，建文帝朱允炆到底去哪儿了，大火烧了宫殿，有人说烧出具焦尸是皇帝，也有人说早烧成灰了，还有人说他溜出宫当了和尚，不管真是假，朱允炆的天下，就这么没了。
朱棣登基后第一件事就是把已故太子朱标降了名分，吕氏也跟着丢了太后头衔，这招直接把建文帝的正统给抹了，她从前住的宫殿不许再进，只能搬去太子陵边上守着，史书里关于她晚年的记录就一句话，后来她搬到太子陵边上住，最后死在那里，别的什么都没留下。
她儿子们也没落着好，小儿子朱文圭关了大半辈子，别的孩子全被毁了人生，吕氏自己呢，连争的资格都没有，就因为生了皇帝儿子，硬是被拖进皇位争夺里，朱棣嘴上说体谅，可哪有半点情分，改朝换代后，她就成了棋盘上没人管的那颗子。