东三省总督是清朝九大总督之一、设立最晚、存在才五年（1907—1912），统辖奉天、吉林、黑龙江三省，驻地奉天（今沈阳）。总督东三省等处地方兼管三省将军、奉天巡抚事。品级为从一品，钦差大臣，地位居九大总督前列。


1907年（光绪三十三年）设立，裁盛京将军改设，应对日俄侵边、强化东北统治。1912年2月废除，清帝退位，职位终结。

五年有三任总督，第一任总督徐世昌（1907.6—1909.2）直隶天津人，推动东北新政、整编军队、修铁路、建学堂，强化边防，奠定东北近代化基础。


第二任总督锡良（1909.2—1911.4）
蒙古镶蓝旗人，整顿内政、振兴实业、维护路权，1910年成功主持东北鼠疫防控。


最后一任总督赵尔巽（1911.4—1912.2）汉军正蓝旗人，末任总督，续推新政、整顿财政，后任清史馆总裁，主编《清史稿》。


总督府遗址在今沈阳市沈河区盛京路28号。原为盛京将军府，1907年改为总督府，张作霖、张学良亦曾在此办公。