国民党立委陈永康今天质疑称，日菲5月启动专属经济区划界谈判涉及台湾东部海域，台外事部门第一时间表达肯定。但对于6月中旬进入台湾东部所谓根本就不存在的限制水域及专属经济海域的大陆科研船，却强势驱离并公开谴责。
陈永康还批评称，在日菲谈判划分东部海域专属经济区的过程中，台外事部门就算不介入，但涉及台湾权益的部分，台湾必须向日菲驻台外馆表达关切。大陆科研船走的路线其实是日本宣称的专属经济区，台湾固然不支持陆舰的行动，但只批评大陆，不批评日本，在国际法上就是双标。