自建数据库是图书馆依托馆藏特色资源、地域文化特色或学科优势，独立或合作建设的特色数字资源库。有的图书馆把自建数据库称为特色数据库。硕博学位论文库、地方特色数据库等属于图书馆自建数据库。
特色案例：
楚雄彝族师范学院：中缅跨境民族口承文化资料数据库、永州瑶族历史档案数据库、彝族族源资料数据库、彝族文化数字资源平台、彝族文化数据库……
南京师范大学图书馆：本校博硕学位论文库、教师教育资源库
核心建设逻辑：
系统架构上，通常采用内外有别的混合模式。对外给读者用的检索和提交界面，用B/S架构，也就是大家打开浏览器就能访问，不用装任何软件；对内给馆员做数据加工、审核、格式转换的管理后台，则用C/S架构，需要安装专门的工作软件，这样处理大批量数据时更稳定也更安全。
关键支撑技术
1、自建数据库的检索系统以全文倒排索引为核心，通过预先标引文档中的字词位置实现快速定位，省去逐篇扫描的开销；多媒体资源采用分层传输机制，先推送低分辨率预览，再按需加载高清版本，兼顾检索效率与网络带宽。
2、在数据整合层面，系统以XML作为异构数据库的交换中介，借助XSL与CSS实现数据结构层与表现层的分离，使不同格式的后台数据能够在统一检索界面下协同工作。跨库检索依托Z39.50协议构建虚拟数据库视图，将用户请求转换为各数据库可识别的查询指令，实现分布式资源的透明访问与结果汇总。
3、内容发布采用JSP动态网页技术，通过JDBC连接后端数据库，实现数据更新与页面生成的实时同步，支持检索结果的动态呈现与个性化服务。
存在的问题
有的馆建设意识薄弱，觉得买了商业数据库就够了，忽视了自建特色资源；有的馆建完之后宣传不到位，读者根本不知道有这资源；还有的缺乏后续维护经费和技术人员，数据库建好后，链接失效、数据过时，最后成了摆设。
改进的方向
首先是资金，特色数据库从数字化加工到系统维护都需要钱，需要加大资金投入。其次是品类，除了论文地方志、老照片、音视频、非遗档案都可以入库。再者是宣传培训，不仅要挂到图书馆首页，还要嵌入到师生的课程和科研流程里，让大家知道并用起来。最后是维护机制，要有专人跟踪数据更新、链接检查和用户反馈，让数据库真正活起来。
