John Scully正式离开Apple耗时许久，但首席执行官生涯终结于1993年6月18日。执掌Apple十年间，他既有亮眼商业成果，也犯下重大决策失误，最广为人知的标签，便是外界传言他逼走了Steve Jobs。
时间总能扭转公众评价，如今不少人认为历史亏待了John Scully。核心论据是：并非他直接解雇Steve Jobs。但这番辩解略显抠字眼，二人当年矛盾早已无可调和，只是解雇一说确与事实不符。即便如此，John Scully仍是Apple史上争议最大的首席执行官，他既有离谱决策，也留下诸多超前布局。许多由他推动的构想虽非原创，却在离职33年后逐步落地。
John Scully最大的战略失误是过早发布牛顿掌上电脑。他同时扶持功能高度重合的通用魔术公司，两个项目最后全部失败。财经媒体曾将他评为史上最差首席执行官第十四名，并大加批判；可他自传里又将自己塑造成行业先驱，评价两极分化。
曾亲自招揽他入职的Apple联合创始人Mike Markula，在1997年接受《纽约时报》采访时给出中肯评价：“John Scully前五年做得十分出色，后来却偏离了公司核心业务，至今我都不清楚缘由。”
1983年Apple尚处初创阶段，董事会始终不认可Steve Jobs担任首席执行官。首任首席执行官履职失败，临时代管的Mike Markula也不愿长期掌权，公司急需一名稳定的正式管理者。Steve Jobs与Mike Markula牵头寻访，最初瞄准IBM技术高管，却遭对方拒绝，多数行业高管也拒绝Apple邀约，直到他们找到时任百事总裁的John Scully。
John Scully本无意跳槽，猎头专程找上门后，他才答应前往Apple、与Steve Jobs会面。John Scully在自传《奥德赛：从百事到Apple》中回忆，1982年末他带子女逛电脑店，听闻要见到Steve Jobs，孩子们难掩激动。这让他意识到Steve Jobs在年轻人心中拥有非同一般的影响力。
John Scully精通营销，却完全不懂技术。他身上最亮眼的履历，是推动百事盲测挑战赛全国普及，不过该活动由百事基层员工策划落地，并非出自John Scully之手。Mike Markula正是看中他出众的营销能力，认为有此人掌舵，自己便可安心退休。
数次交谈后，Steve Jobs那句：你想一辈子卖糖水，还是改变世界？打动了John Scully。高额签约奖金、股票期权、百万年薪与搬迁补贴，也为这次合作加码。
2010年John Scully坦言，他与Steve Jobs的冲突根源与生俱来：Steve Jobs身兼董事长、最大股东，同时掌管Mac事业部，身份既凌驾于首席执行官之上，又和他业务重叠。早在1984年，《财富》杂志便预判二人合作难以长久，认为情绪化的Steve Jobs迟早会逼走John Scully。
合作初期二人刻意维持和睦，John Scully对外宣称Apple由他与Steve Jobs共同引领，Steve Jobs也曾坦言二人将携手开创Apple的未来。可分歧很快围绕初代Mac爆发。
Mac最初定位平价机型，Steve Jobs不断加码硬件配置，John Scully又敲定高额营销预算，只能抬高终端售价。即便初期销量低迷，营收仍覆盖了宣传成本。Steve Jobs构思出经典《1984》超级碗广告，John Scully起初心存疑虑，内部试映大获好评后才全力支持，可董事会全员反感这支广告。
广告公司已拍下两段超级碗广告时段，30秒版本成功转手，却谎称60秒时段无法出售。John Scully犹豫不决，把决策权交给两名高管，对方坚持完整投放60秒广告。这支广告后来封神，John Scully也收获了这份荣光。
借着广告热度，John Scully复刻百事挑战赛，推出试用Mac活动，允许消费者把电脑带回家试用。但活动耗资巨大，用户试用后大多直接归还，完全没能拉动销量。彼时Apple II销量持续下滑，Lisa电脑亏损严重，公司首次出现季度亏损，开启大规模裁员。
1985年4月，John Scully向董事会摊牌：若不解除Steve Jobs Mac事业部负责人职务，自己将辞职。董事会同意调整岗位，但保留Steve Jobs董事长头衔。John Scully迟迟没有执行，直到高管告知他Steve Jobs正在策划逼宫夺权。5月24日，John Scully当面戳破计划，Steve Jobs直言他不适合执掌Apple，全体董事会成员却全部站在John Scully一边。
会后Steve Jobs单独挽留一小时，恳求继续管理Mac业务，遭到拒绝后黯然离场。John Scully在自传中写下自己当时的崩溃：他当初加盟Apple全因Steve Jobs，如今二人决裂，手中股票大幅贬值，未来职场前景黯淡。
Steve Jobs虽保留董事长头衔，却被发配到偏僻办公楼，只拥有空泛的全球创意规划虚职。1985年9月12日，他告知董事会打算离职创办教育科技公司NeXT，并计划带走Mac核心研发人员。次日John Scully得知挖人名单，随即提议免去Steve Jobs董事长一职，Steve Jobs抢先递交辞职信，还将信件抄送媒体扩大舆论。出乎意料的是，消息公布后Apple股价小幅上涨。
John Scully与Steve Jobs搭档仅两年，只是他十年任期的开端。数据证明他前期业绩亮眼：1983年Apple年营收6亿美元，1993年离职时接近80亿美元。John Scully常称任期内Apple所有好创意都来自Steve Jobs，实则过于自谦。
1987年，他主导制作《知识导航器》概念短片，畅想2011年智能助手、便携办公设备的图景，片中多数设想在多年后逐步落地。1992年，他高调发布牛顿掌上电脑，也埋下致命隐患。产品直至次年8月才上市，竞品抢先占领便携数码赛道；他同时双线投资牛顿与功能重合的通用魔术，两个项目双双亏损。Steve Jobs回归后直接砍掉牛顿产品线，集中资源聚焦核心硬件。
牛顿持续消耗资源，市场竞争加剧让Apple 1993年业绩暴跌。董事会认定John Scully过度沉迷新品研发、忽视盈利，要求他卸任。6月18日，Michael Spindler接任，成为第四任Apple首席执行官。
John Scully留下最具长远价值的布局，便是投资英国芯片企业ARM。如今iPhone、各类智能设备均搭载ARM架构处理器。当年Apple财务窘迫，正是依靠抛售ARM剩余股份换取资金，才有能力收购NeXT、迎回Steve Jobs。不过抛售股权发生在John Scully、Michael Spindler离任后，由下一任首席执行官Gil Amelio主导，Gil Amelio接手的Apple早已千疮百孔，最终促成Steve Jobs回归，开启Apple复兴时代。
