为什么很多排行榜会将南京大学排在华五之末，甚至在华中科技大学和武汉大学之后，从学科评估结果就可窥一二。根据全国第四轮学科评估来看，北京大学、清华大学、中国科学院大学和浙江大学A+数量都是两位数，位居全国前四；中国人民大学、中国科学技术大学、北京师范大学、中国农业大学、上海交通大学、复旦大学和东南大学A+数量都在5-9个之间，科交复也都在全国前十之列，独有南京大学A+数量只有3个，位次接近全国20强之末，而3个A+学科分别是天文学、地质学和图书情报与档案管理，都算不上是热门学科，也无怪乎会被质疑实力不及其他四校了。
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