种种迹象表明，以色列为配合美国针对伊朗的军事行动，进行了长期周密筹备。据央视新闻报道，当地时间 5 月 17 日，伊拉克安全部门知情人士透露，以色列在该国西部沙漠区域搭建了至少两处军事岗哨。早在 5 月 9 日，以《华尔街日报》为代表的多家美媒就曾集中披露，以色列借助萨达姆时期遗留的废弃跑道，在伊拉克沙漠改建临时军事基地，主要承担对伊朗的突袭打击任务，同时随时准备进入伊朗执行飞行员搜救工作。在美伊冲突持续的五周内，该秘密基地累计执行了上千次空袭。
3 月初，伊拉克当地一名牧民在附近沙漠发现异常军事活动。接到举报后，伊拉克士兵前往核查，却遭遇炮火袭击造成 1 死 2 伤。该消息来自伊拉克军队联合作战司令部副司令穆罕默达维，具备较高可信度。后续伊拉克反恐局派出的小队经核查，确认了以军活动痕迹，当时伊拉克政府就此提出谴责，并向联合国投诉本国境内存在外国军队侵入的痕迹。但随后伊拉克陆军参谋长亚拉拉否认了相关说法，并发布视察沙漠的视频，称没有任何迹象显示以色列曾在该区域活动。
从客观条件来看，伊拉克沙漠长期人烟稀少，该国武装力量日常巡逻无法实现全域覆盖，以色列潜入沙漠腹地修建秘密基地确实具备可能性。同时出于打击伊朗的需求，以色列不可能完全依赖长途奔袭 —— 这种方式损耗大且效率偏低，因此有动机在伊朗周边部署秘密基地执行特种任务。
伊拉克的否认并不代表消息不实，这并非为以色列开脱，而是基于三方面考量：其一，伊拉克作为主权国家，境内出现他国军事力量甚至沦为袭击第三国的跳板，有损国家尊严；其二，伊拉克在经济与安全层面对美国仍有依赖，其每年上百亿美元石油收入均存入美联储的伊拉克政府账户，而美以是铁杆盟友。有消息称美方曾告知伊政府不要靠近相关区域，说明美方很可能知情甚至协助以方建基地；其三，此举是为安抚伊朗。自萨达姆倒台、什叶派掌权后，两伊从宿敌转为盟友，伊拉克亲什叶派民兵是安全力量重要组成部分，承认以方基地恐引发内部不满。而伊朗方面，因基地停火后已废弃，追究无意义，也不愿认可报道避免影响两伊关系。
这实则是伊拉克政府权衡后的无奈选择。而以色列在伊朗周边的前沿部署不止伊拉克：以方已多次证实在阿联酋部署 “铁穹” 防空系统，内塔尼亚胡称冲突期间访阿却被否认，可见阿联酋已有成为对抗伊朗前沿的趋势。对伊朗而言，中东矛盾若以伊斯兰世界与以色列为主则有利，若以逊尼什叶宗教矛盾为主则不利。目前仅阿联酋与伊交恶，沙特仍希望与伊签署互不侵犯条约，说明海湾国家整体求缓和，未被以色列挑拨。
总体而言，美伊冲突不仅激化了伊朗与美以的矛盾，也彻底改变中东安全格局。冲突后美国在中东军事存在势必削弱，沙特等国将寻求安全多元化，这对伊朗是战略利好，但处理好与海湾国家的地缘宗教矛盾，仍是伊朗的重大考验。