历史进入13世纪，蒙古崛起，打遍亚欧大陆。对于一个小小的安南并不放在眼里，忽必烈还在未登上汗位之前，就想着攻下了大理再顺手拿下安南。于是，在1257年，忽必烈派手下大将兀良哈台（蒙古开国大将速不台之子）征讨安南。也是一样，初期进展顺利，并占领了陈朝都城升龙（今河内），其国王弃城而逃。但由于天气炎热，蒙军水土不服，疫病流行，兀良哈台在升龙驻军仅九天就班师回了云南。而越南陈朝则请罪内附，愿为藩属。 忽必烈建立元朝之后，四处征战，当然也没忘了安南，也是想将其纳为直辖郡县。分别在1285年、1286年两次派自己第九子、镇南王脱欢征讨安南。都是跟第一次一样，初期进展顺利，但时间一长，粮草不济，人员不适应当地气候，造成大量非战斗减员。再加上陈朝军队利用元军不擅丛林山岳作战的弱点，出动小股兵力不断袭扰元军。同时，还在元军撤退之路上进行伏击，致使元军损失不小，有多名将领中毒箭阵亡，或是被其俘虏。元军的第三次征讨也在1287年撤出，还是没能将安南收为郡县。至1288年，越南陈朝君主派使臣上表称臣纳贡，永为藩属，战火方熄。