南通这座城市发展高等教育上的一大遗憾，就是南通大学的创建与整合时间太晚了。如今来看，南通大学若能保留曾经那些优势学科，至少也是 211 高校的水准。 就拿曾经的纺织系它去了上海后发展成为如今赫赫有名的东华大学。看似南通把优质资源拱手让人是一种不明智之举，但从当时的情况看，交通不便使得资源外流似乎也是无奈之举。可仔细想想，南通本可凭借这些学科优势发展自身高校实力，却最终没能留住。 还有曾名声大噪的南通医校，它南迁苏州成了南通永远的痛点。若当年没有南迁，凭借其深厚底蕴，百年南通大学成为 211 应该不在话下。有人可能会说当时学校去上海和苏南是为了更好的发展资源，这似乎也有道理，可南通为它们提供了优质的学科基础，得到的却是苏南一些冷嘲热讽，着实让人心寒。 再看农田水利学科去了扬州，这些优质学科的流失，就像原本要搭建高楼的砖石被一块块搬走。也许有人觉得是南通自身实力不够强所以留不住，但从学科本身的潜力看，若是当时南通能有更好的发展环境和条件，完全可以将这些学科优势转化为高校实力。南通本可以在高等教育上大放异彩，却因为种种原因错失了机会，着实可惜。
