邱清泉和他指挥的第二兵团在陈官庄战役中被全歼，邱清泉也兵败身死，以邱清泉为司令的国军第二兵团，下辖第五、七十、七十二、七十四（重建的）、十二军5个军，其中第五军号称国军“五大主力”之一，整个兵团超过12万人，核心力量第五军有5万之众，在东北的廖耀湘西进兵团、徐州的黄百韬兵团、黄维兵团相继覆灭后，邱清泉兵团成了国军仅存的主力兵团，随着邱兵团被全歼，国军再无主力重装兵团。 关于邱清泉的死因有三种说法，第一种是可信度最高的击毙说，邱清泉突围时穿的是国军普通士兵服，他死后解开衣服大家看到他胸部连中七弹，于是分析判断，是一长串机枪子弹扫射过来，将邱清泉击毙的。邱清泉的尸体经被俘的国军第二兵团的军长、师长们的辨认，确认是邱清泉无疑。随后邱清泉被殓棺埋葬，墓前竖一木牌，上写：“乐清（永嘉）邱清泉之墓”。 第二种说法是邱清泉在神志失常的情况下被流弹打死，1949年1月10日，邱清泉突围出陈庄后一直在陈庄以北的张庙堂附近原地转圈，他到处乱跑大喊大叫，后来尸体被发现的地点是张庙堂村西南四百米处的旷野中，据推测可能是死于炮击或流弹。 第三种说法是自杀说，说邱清泉命令通信兵何永福向自己开枪，一枪击中左胸，一枪击中右胸，邱清泉倒地，但双目未闭，自知未死，又拿枪自射两枪，均未射中身体，后因流血过多，力竭而死。跟随邱清泉逃跑的警卫营营长远硕卿，天亮后见到搜索战场的解放军，遂举手投降。因远硕卿已化装成士兵，又身负轻伤，解放军予以释放。 第三种说法很不可信，如果邱清泉真的是自杀，应该朝头部开枪，怎么会在胸部连中七弹呢，邱清泉身中七弹是有当事人核实的，在场的被俘国军将领确认无误后才将邱清泉埋葬的，所谓自杀说无法是蒋为了掩人耳目自找台阶而已。 前两种说法差别不大，都印证了邱清泉是在战场上被打死的，只是当时神志正常不正常的区别，不过邱清泉一向骄横，黄百韬兵团覆没后，杜聿明率邱清泉、李弥、孙元良三个兵团于1948年11月30日撤离徐州，邱清泉人马最多，有十几万之众，是杜聿明集团中实力最强的一个兵团，邱清泉依然有恃无恐，对参谋长李汉萍说：“现在是海阔天空，任我高飞。”在杜聿明集团被围在陈官庄后，邱清泉精神状态很不好，参谋长李汉萍就经常发现邱清泉喝得酩酊大醉，蒙着头睡在床上什么也不闻不问，李汉萍向他请示办法，邱清泉居然说：‘让他崩溃好了！”可见邱清泉极有可能癫狂状态下被击毙的。
