成立刚好40天的叙利亚临时政府正面临叙利亚内部的阻碍，比如割据北部的叙利亚库尔德武装势力以继续保留军事特权作为表面归编叙利亚军方的条件，比如任命外国人担任叙利亚新军队军官的决定遭到质疑。 沙特媒体Arab News当地时间1月20日报道，叙利亚临时政府国防部长卡萨拉（Murhaf Abu Qasra，图）接受英国媒体路透社采访时称，库尔德武装派系“叙利亚民主军（SDF）”领导层宣称要继续保留他们在叙利亚北部的“自治”权力。 自2024年12月10日成立临时政府以来，叙利亚艾哈迈德·沙拉政权将重心放在外交与收编叙利亚各地军阀。外交方面，沙拉政权效果明显，欧美、中东多国纷纷抛出橄榄枝。 尽管1月初沙拉政权与SDF发言人都宣称叙利亚各路军阀同意归编到叙利亚国防部，但在收编工作上，尚无成效。 在过去14年里，由美国扶持的SDF割占叙利亚粮食与能源最丰富的北部广大地区，美军与SDF这对合伙人利用当地丰富资源，与外界生意做得风生水起，双方赚得钱都无需不用上缴叙利亚国库或美国国库。 报道称，SDF领导层要求，要想让他们归编叙利亚国防部，首先叙利亚临时政府得权力下放，不得解散SDF，得同意SDF以半自治的“军事集团”继续在叙利亚北部掌握实质控制权。 叙利亚临时国防部部长卡萨拉在当地时间1月19日驳斥了SDF的要求，指责SDF故意拖延叙利亚军方的整合工作。卡萨拉称，计划在3月1日叙利亚临时政府解散之前完成叙利亚军队的整合。 报道还指出，叙利亚临时政府任命不少埃及、约旦等外国公民在新军队中担任各级别军官，此举遭到批评。对此，卡萨拉承认这一决定引发了轩然大波，但表示外界并没有提出对任何“外国战斗人员”的引渡引渡。 叙利亚临时政府的权力目前归属于由艾哈迈德·沙拉领导的叙利亚叛军“沙姆解放组织”（HTS），HTS曾割据叙利亚西部一隅，占领的地盘远小于SDF。HTS里面，除了众多叙利亚极端叛军，还有不少外国恐怖分子。HTS在叙利亚掌权后，叙利亚临时政府与军方领导层不乏这类人。
