当真觉寺始建于明永乐年间，是明成祖朱棣专为从西域来京的梵僧班迪达修建的，明成化九年（1473年）真觉寺建成。 清朝时，因避雍正帝胤禛之讳，改名为“正觉寺”；清乾隆十六年（1751年） 进行重修，乾隆二十六年（1761年）又进行了一次重修；清末，真觉寺的建筑曾毁于一场大火，仅有金刚宝座塔幸存；1927年，寺院被卖给一个黄姓商人，所有殿堂被拆毁，仅留下金刚宝座塔。 1987年，北京市政府批准利用真觉寺旧址成立北京石刻艺术博物馆，在金刚宝座东、北、西三面共设7个石刻露天陈列区；同年10月7日，北京石刻艺术博物馆正式对游客开放。 真觉寺又名五塔寺，其名称来源于真觉寺最著名的文物，五座密檐方塔，该塔全部用汉白玉建造，正中的一座共十三层，四角每座为十一层，中塔的正南还有一座两层檐的琉璃罩亭，整座塔周身布满雕刻，塔基和塔身均有精美的石刻图案，真觉寺金刚宝座塔于1961年被列为第一批全国重点文物保护单位。 真觉寺内收藏的石刻种类繁多，包括石碑、石雕、墓志铭等，共设有九个陈列区，专门用于展示这些石刻文物，寺内现藏石刻文物总数2600余件。
