清朝是中国历史上第一个在台湾岛设置府县和省的王朝。康熙统一台湾后，就在台湾设置了台湾府，府下设置了三个县。这是中国历史上首次在台湾岛设置了行政区划机构，之前的元朝和明朝的澎湖巡检司只能管辖澎湖列岛。到了清朝后期，由于台湾岛的人口不断增加，台湾岛的军事位置越来越重要，清朝就直接在台湾设置了台湾省，省下分为了三个府和一个直隶州。
清朝在台湾一共管辖了200多年，在国际上形成了的影响是很大的。1943年，开罗会议上，美国提出要将台湾设为国际共管地区，由美国驻军。而中国强烈反对，认为台湾岛在清朝属于中国，是《马关条约》被迫割让给日本，应该归还中国。最终，中国的呼声得到了美国的同意，于是在二战结束后，中国成功收复了台湾岛。
