《沉默的荣耀》迎来了一个悲壮的大结局，吴石、朱枫、聂曦、陈宝仓都暴露被捕了，就连老杜也为了掩护黎晴的撤离跟翁连旺等人一起同归于尽了，还有就是蔡孝乾叛变以后，出卖了一千多人，仅黎晴等几个人幸存，真是看得让人泪目。
不过，这背后却是这些牺牲的人用生命托举出的情报，一份关于舟山群岛和台湾布防的情报，这是何等的悲壮，让我们一起看看到底发生了什么。
一、谷正文通过王昌诚和阿菊找到了朱枫在舟山的亲戚，带着黎晴等人去舟山抓捕，黎晴没能救下朱枫却接下了朱枫手中的情报。在蔡孝乾第一次被捕逃脱以后，谷正文通过蔡孝乾那一个有印记的电话号码找到了王昌诚，得知了这个是打到他们家中的，这让王昌诚和阿菊就被人盯上了。
最后，为了自保，王昌诚和阿菊出卖了朱枫，告诉了谷正文朱枫在舟山的亲戚是谁，这让谷正文连夜带着黎晴还有其他人赶往舟山。
而朱枫这边虽然已经到舟山十多天了，可是正好赶上舟山一直在下雨，无法出海，她滞留在这里根本走不出去，让她也十分焦急，只能暂时躲在那个医生亲戚给安排的病房中，没想到谷正文却带人赶来了医院，还在一直挨个搜索。
黎晴发现朱枫以后，打算救她，带她从后门走，可惜碰到了两个其他特务，这让黎晴和朱枫都感觉到了，只能奋力一博了，黎晴果断开枪，打死了这两个人，还给了自己胳膊上一枪，让朱枫逃走，可是，朱枫却觉得自己走不了了，把情报和交通员的信物给了黎晴，让她替自己当这个交通员，就拿起那个特务留下的枪准备自杀，可惜的是没有子弹了，朱枫只能再次准备自杀，被黎晴按住了，这个时候谷正文正好带人赶过来了，造成了黎晴抓捕了朱枫的假象。
谷正文就关押了朱枫，还让黎晴赶紧去治伤，虽然他看到了死的两个特务有些疑惑，但是被胜利冲昏头脑的他并没有细想，关注点只在朱枫身上。
没想到这个时候朱枫却偷偷的把自己的金饰用牙咬，用手掰，然后混着水喝下去了，还忍着剧痛一声不吭，为的就是不被发现，报了必死的决心，可惜，第二天早上还是被送饭的人发现了，这让舟山这边的医院查不出她是怎么了，谷正文只能赶紧让毛人凤给安排军机回台北，生怕朱枫死了。
可是，谷正文冒险非要挤上的军机已经超载了，本来他觉得自己的事情比较重要，上去看到全是伤员以后也震撼了，黎晴就在这个时候表示自己留下来，让谷正文他们先走，谷正文就安排两个人照顾好黎晴，明为照顾，其实是在监视。
二、黎晴想办法在舟山给聂曦打了电话，告知了朱枫被捕，情报在自己手中一事，也告知了自己无法出舟山的情况，吴石、聂曦、陈宝仓都为黎晴出舟山不惜一切代价想办法。黎晴知道这两个人是留下来监视自己的，费劲儿躲过以后给吴石办公室打了电话，让聂曦接电话，却被赶过来的两个特务盯着，黎晴只能用暗藏玄机的语言告知舟山的情况。
吴石得知朱枫被捕以后，情报到了黎晴的手中，但是，黎晴现在被困在舟山的定海无法出去，这也是比较难的一件事，因为国民党管的太严了，出海非常困难。吴石听到后高血压犯了，住进了医院，没想到在电梯中正好碰到了谷正文带着朱枫也上电梯，谷正文故意让吴石看到了朱枫，还告知朱枫吞金自杀被救过来一事，让聂曦非常气愤，幸好吴石拦着才没有出事儿。
吴石知道现在的情况比较严峻了，他就让聂曦安排通行证和船票，让聂曦带着王碧奎和两个孩子，还有阿美一起去香港，他会重新给聂曦一份情报，他这样是为了救聂曦，也能传出情报。
可是，蔡孝乾被再次抓到以后，他就叛变了，指认了当时救林义良的人就是聂曦，让聂曦被谷正文的人盯上了。而聂曦也知道吴石让他离开是想着一个人扛下所有，为此，聂曦没有上船，他偷偷的走了，没有人知道他去哪里，其实他在玩灯下黑，他烧毁了一切有价值的东西以后，还留下了遗书，准备把一切揽在自己身上，来洗脱吴石的嫌疑，而且他也冒险去了发报处，给香港的万景光发报，让他们安排人去接应黎晴，可惜只发了一半就被抓了。
吴石看到聂曦被抓以后，他偷偷的去了国防部的发报处，以公务为由，让发报员发出了情报，虽然谷正文赶到了，还是晚了，吴石被带走以后，面对谷正文的审问，他回答的是滴水不漏。
可是，让人没想到的是王碧奎和阿美因为在得知两个人关于聂曦去留的说法不一样的情况下，他们没有上船，王碧奎还被谷正文带走了，不知道原因的王碧奎说出了去见朱枫和朱枫经常去她家一事，让谷正文抓到了把柄去吴石家里搜索，但是没有结果。
其实，在吴石安排好一切，去发报之前他也将朱枫和黎晴的情况告诉了陈宝仓，为此，陈宝仓这边就借着去送军需物资一事，安排老杜去了舟山，让他掩护黎晴出舟山，自己也不要再回来了，让他和黎晴一起走。
三、老杜为了掩护黎晴跟翁连旺等人同归于尽，黎晴精疲力尽后，在海上漂流一夜后，遇到了前来接应的人，陈宝仓和聂曦均为吴石顶罪，最终吴石也承认了一切。谷正文在抓捕聂曦、吴石以后，也察觉到了当时黎晴抓捕朱枫时的事情比较奇怪，再加上舟山那边曾经有人来核实黎晴的身份，让谷正文对黎晴产生了怀疑，他让翁连旺带人前去抓捕黎晴，正好老杜跟翁连旺等人一架飞机去的，老杜以查公务为由，得知了翁连旺等人去舟山的事由，就一路尾随前去。
而黎晴这边呢，也一直在想办法摆脱盯着她的两个特务，终于，她瞅准机会逃到了码头，找了一艘小船，她通过别人教她的方法，艰难的划着船前进，刚走没多远就被翁连旺带人追过来了，还打伤了黎晴，可是，眼看着追不上的翁连旺让人开船，那个人却借机跳海走了，尾随前来的老杜假意帮他们开船，没想到开出一段距离以后，老杜突然改变方向，还朝翁连旺等人出手，虽然老杜身手敏捷，打死了那些特务，但是自己也被翁连旺打中了，最后他为了掩护黎晴拉了手雷，跟翁连旺等人同归于尽了。
黎晴看到这震撼的场景，也只能忍着新伤和旧伤的疼痛，拼命的划着小船，直到筋疲力竭的时候，她只能拿出情报和那个铜表信物，紧紧的攥着，任由小船在海上漂流。
幸运的是，万景光在接到吴石的电报以后，他就赶紧发报给华东局的人，让安排人接应黎晴，他们在海上搜寻的时候，看到了黎晴，救了她，也拿到了情报。
而台湾这边呢，吴石被捕以后，谷正文拿不出证据，只能拿着聂曦的遗书去找吴石，企图用吴石重情义的软肋，让吴石招认，但是，吴石还是什么也没有说。而陈宝仓在得知黎晴已经获救的消息以后，知道情报已经传出去了，而且他也在两三个月之前让家人离开了，自己孤身一人来到吴石家中，他在自己送给吴石的玉石盒的夹层中放入了一份胶卷，然后去保密局承认自己就是“东海”，为的就是为吴石顶罪。
谷正文为了让吴石认罪，又将陈宝仓为他顶罪一事告诉了吴石，吴石看到这几个人纷纷为自己顶罪，他也不能退缩了，承认了自己就是“东海”。
看到吴石、朱枫、陈宝仓、聂曦这样，蒋介石为此非常生气，下令处死他们，虽然他们几个都死了，但是在处死之前，他们得知了舟山群岛解放的消息，也是一种安慰吧！
《沉默的荣耀》结局了，吴石、朱枫、陈宝仓、聂曦等人被处死了，还有蔡孝乾出卖的一千多人都被抓的被抓，被处死的也很多，导致了辛苦建立的潜伏网络几乎殆尽，只有黎晴等少数几个人幸存。
不过，他们的这种精神一直值得后世人的学习，值得我们敬仰，他们用生命托举出来的情报并没有白费，舟山群岛解放了，对于他们来说自己的牺牲是没有白费的，是值得的。只不过最后仅黎晴几个人幸存多少有些让人伤感，让人流泪，这个悲壮的故事也永远被人记住了……
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