水产界的新利器出炉!预防鱼虾旧病和新病,都不在话下!

一号会水产 2024-03-18 05:31:03

一种能够以极快的速度筛查多种病原体的机器,即将在全球水产养殖市场上推出。

一、水产界的利器横空出世!

Standard Biotools的Biomark X9 允许用户同时对96个基因进行实时PCR。

Biomark X9高通量基因组学系统为水产养殖实验室(无论是在养殖场还是在研究机构内)的PCR和下一代测序 (NGS) 工作流程提供经济高效、高通量和自动化的解决方案。

Biomark X9由Standard BioTools(以前称为Fluidigm)开发,有可能明显提升各种规模的鱼虾养殖场的生物安全水平,因为它提供对任何迫在眉睫健康威胁的早期预警,并快速诊断水中或动物本身中存在的任何病原体。

该系统产品经理Phillip Kilgas表示,虽然X9是为人类健康领域开发的,但该公司将水产养殖视为最有前途的多元化途径之一。特别是由于养殖物种的多样性、导致水产养殖的病原体的多样性,以及许多水产养殖系统的开放(相对非生物安全)性质。

Phillip Kilgas介绍:“Biomark X9比其他畜牧业(例如牛或家禽)更适合水产养殖,因为我们的技术更适合,牛和家禽只需要处理少量病原体,一次只能处理几个样本,因此更传统的PCR方法非常适合他们。另一方面,水产养殖涉及每个养殖场的大量动物和多种疾病,使得这种环境非常适合我们的技术。”

据Phillip Kilgas介绍,Biomark X9结合了许多以前需要大量设备才能实现的功能。

“我们的研发团队找到了一种方法,将这些整合到一个仪器中,并将不同的应用程序放在一个平台上。例如,Biomark X9 可以在一个系统中进行实时PCR和NGS文库制备,它是市场上第一款能够处理这两种应用的仪器,这将使研究人员和养殖户能够接触到数量不断增加的基因组。可以在水产养殖领域进行应用。”

Biomark X9 2022年底推出,最初专注于PCR,最近添加了NGS功能。

Phillip Kilgas强调:“我们在公共卫生领域、应对新疾病和疫情方面已经取得了很大成功,我认为这同样适用于水产养殖,因为影响该行业的病原体种类繁多。”

旧版本的Biomark相当大,最新型号更加便携。

值得注意的是,尽管功能有所增加,但这些机器变得更加便携。

“我们正在整合设计,使其成为一个更小的台式平台,尽管这些机器主要设计用于陆上实验室,但它们也已在更多测试条件下成功进行了试验。”

“一位客户在一艘船上安装了一个,用于在捕鱼季节监测阿拉斯加的鲑鱼游动情况,以帮助了解它们的迁徙模式。然而,这是一个独特的用例,我们必须完成一项非常具体的工程壮举,这不一定是可扩展的。”

Phillip Kilgas表示,尽管这台机器很复杂,但操作起来却很简单。

“这几乎是即插即用的。Biomark X9的操作与传统PCR类似,但由于我们使用小体积,并将多种检测组合到一块板中,因此可以更快、更轻松地一次性执行多个实验。”

Phillip Kilgas认为,与更成熟的测试设备相比,它具有许多优势。

“这是从几个角度来看的改进:您可以进行同时检测,这意味着您可以同时测试多个样本中的多种病原体。我们还将试剂的使用量减少了100倍——我们只需要一种试剂,而传统PCR测试需要100个试剂。这也意味着测试所需的时间和劳动力更少。”

另一个关键优势是机器的灵活性。

“一般来说,人们会被锁定在他们试图检测的目标中。但如果突然爆发一种新的病原体,他们只需要在我们的技术中添加一种检测方法即可检测到它。”

二、目标客户

在销售方面,Phillip Kilgas将政府机构、私人实验室和学术机构视为主要目标市场,特别是在欧洲和亚洲,但随着时间的推移,其覆盖范围不断扩大,部分原因是机器尺寸的明显减小,使其更加便携和适应性强。

“当然,虽然购买机器需要投资成本,但每个数据点的低廉价格(由于化验小型化)以及获得结果的周转时间的缩短,使得我们的技术可以在多种不同的领域实施实验室:从养殖场到研究组织,再到大型渔业,”他解释道。

迄今为止,水产养殖中的应用包括对斑点叉尾鮰的基因表达与生长、应激和福利之间的联系的研究,对基因表达与白斑综合症病毒(WSSV)对南美白对虾的影响之间的联系的研究,以及对这种联系的研究。大西洋三文鱼的基因表达与免疫反应、福利和流行病学之间的关系。

全新Biomark X9投入使用

该系统的用户包括阿伯丁大学苏格兰鱼类免疫学研究中心主任萨姆·马丁教授,他对该系统的速度和容量印象深刻。

正如他解释的那样:“它使我们能够同时对96个基因(可能来自96种不同的动物)进行实时PCR。优点是我们能够真正增加我们正在观察的不同个体和复制品的数量,并使用大量我们知道可以告诉我们鱼虾的健康状况的标记。”

“我们已经开展了许多研究复杂鳃病和AGD的分子基础的项目。我们之前的工作使用深度测序:这是一种非常昂贵且耗时的RNA测序形式,每条鱼的成本约为150英镑。现在我们不需要对五条鱼进行昂贵的RNA测序,或者取很多鱼只做一两个基因,我们可以取很多鱼,同时做很多基因——我们可以在一天内做几个月的实时PCR。”

“我们将对大西洋三文鱼鳃的分析与我们的组织病理学工作紧密联系起来,以找到一组作为鱼类健康指标的基因。现在,我们能够做的是从养殖场取出鱼,并使用一整套鱼类健康生物标记物让养殖户了解该鱼的健康状况,我们已经将这些生物标记物描述为指示鱼类健康状况的特征。其他新项目涉及检查抗病毒特征,以帮助了解疫苗接种后的保护作用。”

与此同时,加拿大渔业部和阿拉斯加渔猎局都将其用于野生鱼类种群的研究。

三、未来发展

展望未来,Phillip Kilgas相信,随着Biomark X9的发展,它的使用方式也会不断发展。

“随着养殖户更好地了解技术和当地病原体,他们将能够从被动防御状态转变为主动预防状态。因为我们可以轻松地调整我们的检测方法以适应任何类型的实验,如果他们有迹象表明可能存在病原体,我们可以以很少成本进行检测方法,以便养殖户能够对其进行常规检测。”

他还认为X9可以帮助提高水产养殖业的可持续性,土霸王该机器可以变得更加灵敏,以实现更高水平的病原体检测。

“这项技术适合水产养殖界中对疾病管理、养殖策略和一般动物福利感兴趣的每个人,以及希望使用新的高通量和易于使用的基因组工具来改进上述内容。我们期待与客户讨论他们的需求和痛点,以便我们能够继续开发这项技术。”

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一号会水产

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