结果是灾难性的。被囚禁了两年，但有幸存活下来，甚至在二战中出任高级将领的康斯坦丁·罗科索夫斯基（Konstantin Rokossovsky）表示：“这比在战场上用炮火杀死自己人还要糟糕。” 高级将领遭受的打击最为严重。五位元帅中的三人，十五名军团司令中的十三人，以及九名海军舰队司令中的八人成了刀下冤魂。

军队的整个指挥链都受到了重创。“有太多人遭到了处决，还破坏了从上至下的各级指挥架构。”赫鲁晓夫写道，“结果，我们的军队失去了在内战时期积累了丰富经验的骨干力量，要毫无准备地面对一个新的敌人。”

并非只有赫鲁晓夫有此感受。根据斯特潘·米高扬（StepanMikoyan）的回忆，他的父亲阿纳斯塔斯·米高扬在家中对此直言不讳。父亲告诉他，苏联损失了这么多经验丰富的军官，这“对为抵御希特勒进攻而进行的战备及战争进程本身，都产生了毁灭性影响”。

斯大林的传记作者伏尔科戈诺夫将军认为，“大清洗”“导致了1941年的失败，数百万人因此丧生”。