南京临时政府各省地方政权机关为辛亥革命后创立的军政府（都督府）。置都督一人掌理全省军民两政，府内置设各部、院、局、处机构，全国仍无统一建制。1912年2月4日，临时政府因中央行政机关称“部”，电令各省都督府之“部”一律改称为司重新厘定，以昭化一；2月19日电令各省裁撤军政分府，都督府内设司令部，专管军事；民、财两政悉由地方官主持，以倡“军民分治”。
南京临时政府之辖区，包括江苏、浙江、上海、福建、安徽、江西、湖南、湖北、广东、广西、四川、云南、贵州、陕西、山西等十五省区。在山东、河南、河北、甘肃、新疆以及东三省，虽曾建立过军政府，但均属临时性的地方革命政权。就全省政局来说，这些省仍属于清王朝之政治营垒。
江苏都督府
1911年12月2日南京光复后，都督府从苏州迁宁，并行改组。同时裁镇江都督府，另置江北都督。1912年1月9日督府迁至苏州。
都督
程德全（1911.11.5.任；1912.1.1.病假），四川云阳（今属重庆）人，原清末江苏巡抚。
庄蕴宽（1912.1.1.代），江苏武进人，原清末上海商船学堂监督。
浙江都督府
依1912年7月修正的《浙江都督府官制》规定，都督府设秘书、军咨，参议3处，以及民政、财政、教育、提法4司。
都督
汤寿潜（1912.1.1.调），浙江萧山人，实业家、政治家、活动家，晚清立宪派领袖人物。
蒋尊簋（1912.1.11公推；1.16就职），浙江诸暨人，同盟会成员，曾任清末新军协统。
沪军都督府
1911年11月6日建，1912年9月裁，并入浙江都督府、初设司令、参谋、军务、外交、民政、财政、交通、海军等10部。后改置参谋长、副官长、民政厅、财政厅、执法处以及人事、谍报、调查3科。任免职官不详。
都督 陈其美，浙江吴兴人，同盟会元老，孙中山重要助手。
福建都督府
据1911年12月颁行的《都督府大纲》规定，都督府主要官署为政务院、参谋部、司令部。在政务院内分置民政、外交等8部。
都督 孙道仁（1911.11.11.任），湖南慈利人，同盟会成员，原清末福建提督，闽军头面人物。
安徽都督府
1911年12月21日正式组建。初置军致、民政、财政、教育4司，后改置司令、参谋、军务3部。
都督 孙毓筠（1911.12.21.就任），安徽寿县人，同盟会成员，辛亥革命爆发后任江浙联军总部副秘书长。
江西都督府
1911年11月1日成立。翌年1月三次改组。设7部4厅。同时裁九江、赣州各军政分府。
都督
彭程万（1912.1.任），江西贵溪人，同盟会成员，后受马毓宝排挤，去职。
马毓宝（1912.2.8.辞），安徽蒙城人，清末新军标统，辛亥革命爆发后被推为九江军政分府都督，1912年任江西都督，旋被劾去职。
李烈钧（1912.2.8.推选；3.19.就职），江西九江人，同盟会成员，二次革命首义都督。
湖北都督府
1911年10月11日首建军致府。25日颁布《中华民国鄂军政府改订暂行条例》，设军令、参谋等9部，同时成立省议会。开国后职官沿革不详。
都督 黎元洪，湖北黄陂人，原清末新军协统，兼管长江舰队，辛亥革命首义都督。
湖南都督府
1911年10月22日建立。置参议院，顾问厅及军政、民政2部。
都督
焦达峰（1911.10.22.任），湖南浏阳人，同盟会成员，10月31日立宪派谭延闿策动新军管带梅馨发动政变，他与副都督陈作新同时被害。
谭延闿（1911.10.31.任），湖南茶陵人，原湖南立宪派首领，10月底立宪派杀害焦达峰、陈作新后，他被咨议局推举为都督。
广东都督府
1911年11月9日成立。初辖军事、财政、民政等8部。
都督
陈炯明（1911.12.24.任），广东海丰人，同盟会成员。
胡汉民（1912.2.22.任，未就），广东番禺人，同盟会成员，孙中山重要助手。
汪兆铭（1912.2.23.任，陈炯明代），广东三水人，同盟会成员。
广西都督府
1911年11月7日建任。1912年2月军政府改组，下置4司2局。
都督
沈秉堃（1911.11.7.任），湖南善化人，原清末广西巡抚，因受副都督陆荣廷排挤，被迫率广西混成协赵恒惕部援鄂。
陆荣廷（1912.2.8.任），壮族，广西武鸣人，原清末广西提督，他在逼走沈秉堃、王芝祥后总揽广西军政。
南宁军政府
副都督 陆荣廷（1911.11.9.任；1912.2.8.升任都督；1912.3.1.裁）
右江军政分府
1911年11月9日建于柳州，1912年3月1日裁。
总长 刘古香（1912.3.1.改任统领），广西马平人，同盟会成员，后改任右江水陆统领。
蜀军军政府
1911年11月22日建立于重庆、翌年2月2日并入四川军政府。
都督 张培爵（1911.11.22.任；1912.2.2.改任四川军政府副都督），四川荣昌（今属重庆）人，同盟会成员。
大汉四川军政府
1911年11月27日成立于成都。12月改组。1912年2月2日改建为四川军故府。
都督
蒲殿俊（1911.11.27.任），四川广安人，四川保路运动领导人，12月8日因成都兵变被迫离职。
尹昌衡（1911.12.8.任），四川彭县人，同盟会成员，成都光复后任四川军政府军政部长，同年12月8日平定成都叛乱，被推为大汉四川军政府都督。
四川军政府
1912年2月2日由成、渝两军政府合建。
都督 尹昌衡（1912.2.2.任）
副都督 张培爵（1912.3.12.就任）
云南军政府
1911年11月3日正式成立于昆明。初置参议院及军政、参谋、军务3部。
都督 蔡锷，湖南邵阳人，原清末新军协统。
贵州军政府
1911年11月4日建立，以都督、行政总长、枢密院3部组成。
都督
杨荩诚（1911.11.4.推任），土家族，四川秀山人，同盟会成员，后因贵州宪政派与滇军唐继尧部压迫，去职。
唐继尧（1912.3.4.任），云南会泽人，同盟会成员，原清末新军管带，云南光复后，唐奉命率军援黔，事后被推举为都督。
山西军政府
1911年10月29日成立于大原，12月13日与清军作战失利北上，1912年1月8日退守包头。
都督 阎锡山，山西五台人，同盟会成员，原清末新军标统。
河东军政府
1911年12月31日陕西民军攻占运城，次日建立军政府。1912年4月4日裁撤。
兵马节度使兼民政长 王用宾，山西猗氏人，同盟会成员。
大同军政府
1912年1月初成立于大同，是月15日失败。
都督 李德懋，山西大同人，同盟会成员。
秦晋蜀北伐先锋队
1912年1月13日成立于包头。
司令官 阎锡山
陕西军政府
1911年10月22日建立秦陇复汉军，11月26日改设军政府。
都督 张凤翙（1911.11.26.由统领改称都督），陕西咸宁人，同盟会成员，原清末新军管带。
北方革命军政府
1912年1月2日第二十镇七十九标管带王金铭、施从云发动起义，次日建立军政府于滦州，旋即失败。
北军大都督 王金铭（1912.1.21.战死），山东武城人，原清末新军管带。
秦州军政府
又称甘肃临时军政府，1912年3月11日建立于甘肃天水。6月7日撤销。
都督 黄钺，湖南宁乡人，同盟会成员，曾任清末甘肃督练公所总参议。
宁夏军政府
1911年11月21日成立，12月失败。
革命军大元帅 孙延寿，原清末宁夏道。
新疆临时都督府
1912年1月7日建立于伊犁。
临时大都督 广福，蒙古正蓝旗人，原清末伊犁将军。
山东军政府
1912年.1月15日正式建立于登州。
都督
胡瑛（1912.1.13.公推；3.19.就职），湖南桃源人，同盟会成员。
刘艺舟（1912.1.15.任），湖北鄂城人，戏曲活动家，编剧。
山东军政分府
1912年2月7日建于诸城，11日失败。
都督 王长庆，山东寿光人，同盟会成员。
