1945年10月15日，国民政府将“昆明防守司令部”改组为“东北保安司令长官部”。驻锦州，归东北行营兼辖。

司令长官

关麟征（1945.10.8.任；10.27.免），陕西鄠县人，黄埔军校一期生，第五十二军系首脑。因怕他不能搞好与苏联的关系，未上任时便被改派为云南省警备司令。

杜聿明（1945.10.26.任），陕西米脂人，黄埔军校一期生，第五军系首脑。“十·三”政变后，他以云南处理失当，着即撤职查办；同天，便被蒋介石任命为东北保安司令长官。

副司令长官

梁华盛（1945.12.11.任），广东高州人，黄埔军校一期生。他在任命发表后未立即赴东北，而是回高州省亲。直至1946年2月下旬杜聿明因病住院，梁才由广东赶往北平看望杜，同时也有代理司令长官职务之意，但未获得杜聿明信任。

郑洞国（1946.3.26.任），湖南石门人，黄埔军校一期生 ，杜聿明好友。1946年2月，杜聿明因重病在北平就医，特电请郑洞国去东北代其主持军务。

参谋长

赵家骧（1945.12.11任；1946.4.22.任），河南汲县人，北洋军出身，曾任杜聿明参谋长。他因在昆明协助杜解决龙云有功，被调升为东北保安司令长官部参谋长，跟随杜聿明赴东北“接收”日军占领地。

第六十军，滇军，1937年9月由滇军6个旅12个团编成。

军长 曾泽生，云南永善人，滇军将领。

第十三军，汤恩伯系基干部队，1935年5月由第4、第89师在湖北编成。

军长 石觉，广西临桂人，黄埔军校三期生 ，汤恩伯系骨干。1947年8月，因不满杜聿明的指挥，率部改隶北平行辕主任李宗仁指挥。

第五十二军，中央军，1937年8月由第2、第25师在陕西咸阳编成。

军长 赵公武，广东大埔人，黄埔军校潮州分校第一期毕业。

第五十三军，原东北军，1933年3月由第108、第116、第119、第129、第130师及骑兵2师在热河合编。

军长 周福成，辽宁辽阳人，原东北军将领。

第七十一军，中央军，1937年9月由第87师在上海编成。

军长 陈明仁，湖南醴陵人，黄埔军校一期生。

第九十四军，中央军，1938年6月由第55、第185师在湖北武汉编成。

军长 牟廷芳，贵州朗岱人，黄埔军校一期生。

新编第一军，中国远征军体系，1942年12月由新编第22、新编第38师在印度兰姆伽编成。

军长 孙立人，安徽庐江人，先后毕业于清华大学、美国弗吉尼亚军事学院，抗战名将，有“丛林之狐”、“东方隆美尔”的美称。

新编第六军，中国远征军体系，1944年4月由第14、第50师、新编第22师在印度兰姆伽合编。

军长 廖耀湘，湖南邵阳人，黄埔军校六期生，中国远征军时期杜聿明的下属，颇有大将之才。

新编第二十七军，伪满投诚部队，1945年9月由冀东挺进军改编。

军长 姜鹏飞（1945.9.7.任），辽宁金县人，原东北军将领。1946年1月经蒋介石批准，赴东北活动，收编旧东北军、伪满军、潜伏日军及地下武装团体约六七万人。

突击纵队司令 马师恭

忠义救国军司令 马励武